Трансмембрана пептидларының күп төрләре бар, һәм аларның классификациясе физик һәм химик үзлекләргә, чыганакларга, ашау механизмнарына һәм биомедицина кулланмаларына нигезләнгән.Аларның физик һәм химик үзлекләре буенча, мембранага үтеп керүче пептидларны өч төргә бүлеп була: катион, амфилик һәм гидрофобик.Пептидларга үтеп керүче катион һәм амфилик мембрана 85% тәшкил итә, гидрофобик мембрана үтеп керүче пептидлар 15% тәшкил итә.
1. Пептидка керүче катион мембранасы
Кионик трансмембрана пептидлары TAT, Пенетратин, Поляргинин, P22N, DPV3 һәм DPV6 кебек аргинин, лизин һәм гистидинга бай кыска пептидлардан тора.Алар арасында, аргининда гуанидин бар, ул күзәнәк мембранасында тискәре корылган фосфор кислотасы төркемнәре белән водород бәйләнешен ясый ала һәм физиологик PH кыйммәте шартларында трансмембрана пептидларын мембранага кертә ала.Олигаргинин тикшеренүләре (3 R дан 12 R га кадәр) күрсәткәнчә, мембрананың үтеп керү сәләте аргинин күләме 8 кадәр булганда гына ирешелгән, һәм мембрананың үтеп керү сәләте аргинин күләменең артуы белән әкренләп арткан.Лизин, аргинин кебек катион булса да, гуанидинны үз эченә алмый, шуңа күрә ул берүзе булганда, аның мембранасына үтеп керү эффективлыгы бик югары түгел.Футаки һ.б..Уңай корылган аминокислота калдыклары үтеп керүче пептидларның мембранага үтеп керүе өчен бик мөһим булса да, башка аминокислоталар шул ук дәрәҗәдә мөһим, мәсәлән, W14 F мутацияләнгәндә, Пенетратинның үтеп керүе юкка чыга.
Катионик трансмембрана пептидларының махсус классы - атом локализациясе эзлеклелеге (NLS), ул аргинин, лизин һәм пролинга бай кыска пептидлардан тора һәм атом күзәнәк комплексы аша ядрәгә ташыла ала.NLS-ны алга таба бер һәм ике кластердан торган төп аминокислоталардан торган бер һәм икеләтә язуга бүлеп була.Мәсәлән, симия вирусыннан PKKKRKV 40 (SV40) - бер язу NLS, ә атом протеины - NLS икеләтә язу.KRPAATKKAGQAKKKL - кыска эзлеклелек, ул мембрана трансмембранасында роль уйный ала.Күпчелек NLS корылмалар саны 8 дән ким булганга, NLSлар трансмембрана пептидлары эффектив түгел, ләкин алар амфифилик трансмембрана пептидларын формалаштыру өчен гидрофобик пептид эзлеклелеге белән коваленталь бәйләнгәндә эффектив трансмембрана пептидлары булырга мөмкин.
2. Амфифилик трансмембрана пептиды
Амфилик трансмембрана пептидлары гидрофилик һәм гидрофобик доменнардан тора, аларны беренчел амфилик, икенчел α-гелик амфилик, fold катлау амфифилик һәм проол белән баетылган амфиликка бүлеп була.
Беренчел типтагы амфилик кием мембранасы пептидлары ике категориягә бүленә, NLSs белән гидрофобик пептид эзлеклелеге белән ковалент рәвештә бәйләнгән, мәсәлән, MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) һәм Pep - 1 (KETWWETWWTEWSQPKKRKV), икесе дә атом локализациясе нигезендә PKKKKKKKKKKKK). MPG домены ВИЧ гликопротеин 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A) кушылу эзлеклелеге белән бәйле, һәм Pep-1 гидрофобик домены югары мембрана якынлыгы булган триптофан бай кластер белән бәйле (KETWWET WWTEW).Ләкин, икесенең дә гидрофобик доменнары WSQP аша PKKKRKV атом локализациясе сигналы белән бәйләнгән.Башлангыч амфилик трансмембрана пептидларының тагын бер сыйныфы pVEC, ARF (1-22) һәм BPrPr (1-28) кебек табигый протеиннардан изоляцияләнгән.
Икенчел α-гелик амфилик трансмембрана пептидлары мембранага α-шакмаклар аша бәйләнә, һәм аларның гидрофилик һәм гидрофобик аминокислота калдыклары гелик структураның төрле өслекләрендә, мәсәлән MAP (KLALKLALK ALKAALKLA).Бета пептид катлау төре амфилик кием мембранасы өчен, бета плиткасын формалаштыру сәләте аның мембрананың үтеп керү сәләте өчен бик мөһим, мәсәлән, VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) мембрананың үтеп керү сәләтен тикшерү процессында, D тибын кулланып. - аминокислота мутация аналоглары бета катлаулы кисәкне формалаштыра алмады, мембрананың үтеп керү сәләте бик начар.Пролин белән баетылган амфифилик трансмембрана пептидларында полипролин II (PPII) полипептид структурасында проолин бик баетылганда чиста суда җиңел барлыкка килә.PPII - сул куллы геликс, борылышка 3,0 аминокислота калдыклары, борылышта 3,6 аминокислота калдыклары булган стандарт уң куллы альфа-геликс структурасыннан аермалы буларак.Пролин белән баетылган амфифилик трансмембрана пептидлары арасында анимикробиаль пептид 7 (Bac7), синтетик полипептид (PPR) n (n 3, 4, 5 һәм 6 булырга мөмкин) һ.б.
3. Гидрофобик мембрана үтеп керүче пептид
Гидрофоб трансмембрана пептидларында поляр булмаган аминокислота калдыклары гына бар, чиста корылма аминокислота эзлеклелегенең гомуми корылмасының 20% тан кимрәк, яки трансмембрана өчен кирәк булган гидрофобик моиетлар яки химик төркемнәр бар.Бу кәрәзле трансмембрана пептидлары еш кына санга сукмасалар да, алар бар, мәсәлән, фибробласт үсеш факторы (K-FGF) һәм Капоси саркомасыннан фибробласт үсеш факторы 12 (F-GF12).
Пост вакыты: 19-2023 март