I. Аннотация
Пептидлар махсус макромолекулалар, аларның химик һәм физик үзенчәлекләрендә аларның эзлеклелеге гадәти түгел.Кайбер пептидларны синтезлау авыр, икенчеләре синтезлау чагыштырмача җиңел, ләкин чистарту авыр.Практик проблема шунда: күпчелек пептидлар су эремәләрендә бераз эриләр, шуңа күрә безнең чистартуда гидрофобик пептидның тиешле өлеше су булмаган эреткечләрдә эретелергә тиеш, Шуңа күрә бу эреткечләр яки буферлар куллану белән бик туры килмидер. биологик эксперименталь процедуралар, техникларга пептидны үз максатларында куллану катгый тыелган, шуңа күрә тикшерүчеләр өчен пептидлар проектлауның берничә аспекты бар.
Дизайн схемасы һәм полипептид пептид чылбырының чишелеше
Икенчедән, синтетик катлаулы пептидларны дөрес сайлау
1. Түбән көйләнгән эзлеклелекнең гомуми озынлыгы
15 калдыктан аз булган пептидларны алу җиңелрәк, чөнки пептидның күләме арта һәм чималның чисталыгы кими.Пептид чылбырының гомуми озынлыгы 20 калдыктан арткан саен, продуктның төгәл саны төп проблема булып тора.Күпчелек экспериментларда калдык санын 20дән түбәнәйтеп көтелмәгән эффектлар алу җиңел.
2. Гидрофоб калдыкларының санын киметү
Гидрофоб калдыкларының күпчелек өстенлеге булган пептидлар, аеруча С-терминалдан 7-12 калдыклар, гадәттә синтетик кыенлыклар тудыралар.Бу төгәл булмаган комбинация булып күренә, чөнки синтезда В катлы таблица алынган."Мондый очракларда икедән артык уңай һәм тискәре калдыкны әйләндерү, яисә пептид составын ачу өчен Gly яки Pro пептидка кертү файдалы булырга мөмкин."
3. "Авыр" калдыкларны тәртипкә китерү
"Cys, Met, Arg, һәм синтезланмаган калдыкларны сынап кара."Сер гадәттә Cys өчен оксидиатив булмаган альтернатива буларак кулланылачак.
Дизайн схемасы һәм полипептид пептид чылбырының чишелеше
Өченчедән, суда эри торган дөрес сайлауны яхшырту
1. N яки C терминусын көйләгез
Кислотадагы пептидлар белән чагыштырганда (ягъни pH 7 тискәре корылган), ацетиляция (N-терминус ацетиляциясе, C терминусы һәрвакыт ирекле карбоксил төркемен саклый) тискәре корылманы арттыру өчен аеруча киңәш ителә.Ләкин, төп пептидлар өчен (ягъни pH 7 уңай корылган), амининация (N-терминалда бушлай аминокруппа һәм С-терминалда амининация) уңай корылманы арттыру өчен аеруча киңәш ителә.
2. Эзлекне бик кыскартырга яки озайтырга
Кайбер эзлеклелектә күп санлы гидрофобик аминокислоталар бар, мәсәлән, Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr һәм Ala һ.б. Бу гидрофоб калдыклары 50% тан артканда, гадәттә эретү җиңел түгел.Пептидның уңай һәм тискәре полюсларын тагын да арттыру өчен эзлеклелекне озайту файдалы булырга мөмкин.Икенче вариант - гидрофоб калдыкларын регуляцияләп уңай һәм тискәре полюсларны арттыру өчен пептид чылбырының күләмен көйләү.Пептид чылбырының уңай һәм тискәре яклары никадәр көчлерәк булса, су белән реакцияләү мөмкинлеге шулкадәр күбрәк.
3. Суда эри торган калдык куегыз
Кайбер пептид чылбырлары өчен кайбер уңай һәм тискәре аминокислоталарның кушылуы суда эрүчәнлеген яхшырта ала.Безнең компания кислоталы пептидларның N-терминусын яки С-терминусын Глу-Глю белән кушылырга тәкъдим итә.Төп пептидның N яки C терминалы бирелде, аннары Lys-Lys.Әгәр дә зарядланган төркем урнаштырылмаса, Ser-Gly-Ser шулай ук N яки C терминалына урнаштырылырга мөмкин.Ләкин, пептид чылбырының якларын үзгәртә алмаганда, бу ысул эшләми.
Пост вакыты: 12-2023 май